Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms