Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms