Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms