Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms