Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXP28300 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXP28300 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXP28300 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXP28300 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXP28300 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXP28300 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXP28300 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXP28300 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXP28300 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXP28300 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXP28300 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXP28300 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXP28300 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXP28300 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXP28300 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXP28300 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXP28300 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXP28300 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXP28300 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXP28300 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms