Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPREP23469 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPREP23469 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPREP23469 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPREP23469 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPREP23469 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPREP23469 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPREP23469 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPREP23469 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPREP23469 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPREP23469 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPREP23469 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPREP23469 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPREP23469 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPREP23469 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPREP23469 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPREP23469 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPREP23469 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPREP23469 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPREP23469 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPREP23469 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPREP23469 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPREP23469 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPREP23469 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPREP23469 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPREP23469 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPREP23469 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPREP23469 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPREP23469 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPREP23469 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPREP23469 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPREP23469 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPREP23469 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPREP23469 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPREP23469 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPREP23469 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPREP23469 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPREP23469 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPREP23469 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPREP23469 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPREP23469 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPREP23469 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPREP23469 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPREP23469 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPREP23469 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPREP23469 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPREP23469 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPREP23469 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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