Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFTRP13569 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFTRP13569 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFTRP13569 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFTRP13569 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFTRP13569 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFTRP13569 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFTRP13569 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFTRP13569 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFTRP13569 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFTRP13569 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFTRP13569 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFTRP13569 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFTRP13569 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFTRP13569 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFTRP13569 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFTRP13569 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFTRP13569 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFTRP13569 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFTRP13569 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFTRP13569 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFTRP13569 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFTRP13569 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFTRP13569 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFTRP13569 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFTRP13569 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFTRP13569 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFTRP13569 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFTRP13569 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFTRP13569 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFTRP13569 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFTRP13569 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CFTRP13569 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFTRP13569 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFTRP13569 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFTRP13569 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFTRP13569 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFTRP13569 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFTRP13569 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFTRP13569 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CFTRP13569 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFTRP13569 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CFTRP13569 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFTRP13569 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFTRP13569 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFTRP13569 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CFTRP13569 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CFTRP13569 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CFTRP13569 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CFTRP13569 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CFTRP13569 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CFTRP13569 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CFTRP13569 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CFTRP13569 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CFTRP13569 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CFTRP13569 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CFTRP13569 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CFTRP13569 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CFTRP13569 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CFTRP13569 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CFTRP13569 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CFTRP13569 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CFTRP13569 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CFTRP13569 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CFTRP13569 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CFTRP13569 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CFTRP13569 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CFTRP13569 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CFTRP13569 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CFTRP13569 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CFTRP13569 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CFTRP13569 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CFTRP13569 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CFTRP13569 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CFTRP13569 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CFTRP13569 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CFTRP13569 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFTRP13569 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFTRP13569 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFTRP13569 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFTRP13569 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFTRP13569 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFTRP13569 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFTRP13569 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFTRP13569 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFTRP13569 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFTRP13569 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CFTRP13569 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CFTRP13569 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CFTRP13569 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CFTRP13569 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CFTRP13569 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CFTRP13569 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CFTRP13569 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CFTRP13569 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CFTRP13569 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CFTRP13569 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CFTRP13569 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CFTRP13569 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CFTRP13569 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms