Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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PKHD1P08F94 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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PKHD1P08F94 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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PKHD1P08F94 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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