Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGFRP00533 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGFRP00533 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGFRP00533 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGFRP00533 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGFRP00533 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGFRP00533 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGFRP00533 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EGFRP00533 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EGFRP00533 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGFRP00533 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGFRP00533 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EGFRP00533 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGFRP00533 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGFRP00533 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGFRP00533 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGFRP00533 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGFRP00533 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGFRP00533 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGFRP00533 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGFRP00533 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EGFRP00533 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EGFRP00533 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGFRP00533 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms