Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms