Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms