Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01387J3KSC0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms