Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1D1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1D1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1D1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1D1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1D1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1D1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1D1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1D1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1D1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1D1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1D1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1D1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1D1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1D1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1D1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1D1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1D1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1D1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1D1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1D1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1D1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1D1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1D1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1D1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1D1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C1D1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C1D1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C1D1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C1D1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C1D1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C1D1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C1D1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C1D1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C1D1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C1D1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C1D1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C1D1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C1D1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C1D1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C1D1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C1D1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C1D1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms