Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RGPD3A6NKT7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms