Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtsjQ9R014 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtsjQ9R014 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtsjQ9R014 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtsjQ9R014 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtsjQ9R014 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CtsjQ9R014 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtsjQ9R014 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms