Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Copg1Q9QZE5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Copg1Q9QZE5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Copg1Q9QZE5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Copg1Q9QZE5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copg1Q9QZE5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copg1Q9QZE5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copg1Q9QZE5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copg1Q9QZE5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copg1Q9QZE5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copg1Q9QZE5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copg1Q9QZE5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Copg1Q9QZE5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Copg1Q9QZE5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copg1Q9QZE5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms