Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SpastQ9QYY8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SpastQ9QYY8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms