Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 MICALL2-215ENST00000496184 2722 ntTSL 220.02■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 50.9
AATFQ9NY61 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.13e-6■■■■■ 50.8
AATFQ9NY61 AKAP17A-203ENST00000474361 3232 ntTSL 1 (best)21.05■□□□□ 0.963e-6■■■■■ 50.8
AATFQ9NY61 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.943e-6■■■■■ 50.8
AATFQ9NY61 EXOC2-201ENST00000230449 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 50.8
AATFQ9NY61 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.59□□□□□ -2.316e-38■■■■■ 50.4
AATFQ9NY61 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 50.1
AATFQ9NY61 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 50.1
AATFQ9NY61 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 50.1
AATFQ9NY61 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 50.1
AATFQ9NY61 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.419e-11■■■■■ 50
AATFQ9NY61 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 49.9
AATFQ9NY61 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 49.9
AATFQ9NY61 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 49.9
AATFQ9NY61 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC8.34□□□□□ -1.075e-16■■■■■ 49.9
AATFQ9NY61 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.882e-9■■■■■ 49.7
AATFQ9NY61 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.372e-9■■■■■ 49.7
AATFQ9NY61 KCNIP2-205ENST00000355657 2617 ntTSL 223.44■■□□□ 1.342e-9■■■■■ 49.7
AATFQ9NY61 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.872e-9■■■■■ 49.7
AATFQ9NY61 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.232e-9■■■■■ 49.7
AATFQ9NY61 KCNIP2-204ENST00000353068 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.562e-9■■■■■ 49.7
AATFQ9NY61 KCNIP2-201ENST00000239117 555 ntTSL 1 (best)11.37□□□□□ -0.592e-9■■■■■ 49.7
AATFQ9NY61 KCNIP2-202ENST00000343195 663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.862e-9■■■■■ 49.7
AATFQ9NY61 KCNIP2-212ENST00000472764 847 ntTSL 59.27□□□□□ -0.932e-9■■■■■ 49.7
AATFQ9NY61 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.052e-9■■■■■ 49.7
AATFQ9NY61 SRP14-AS1-201ENST00000504245 2317 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 49.5
AATFQ9NY61 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 49.5
AATFQ9NY61 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.14e-8■■■■■ 49.3
AATFQ9NY61 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.464e-8■■■■■ 49.3
AATFQ9NY61 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.174e-8■■■■■ 49.3
AATFQ9NY61 PCMTD2-203ENST00000308824 3843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.434e-8■■■■■ 49.3
AATFQ9NY61 PCMTD2-209ENST00000609818 551 ntTSL 48.28□□□□□ -1.084e-8■■■■■ 49.3
AATFQ9NY61 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.053e-8■■■■■ 49.2
AATFQ9NY61 A2M-209ENST00000539638 590 ntTSL 46.6□□□□□ -1.353e-8■■■■■ 49.2
AATFQ9NY61 A2M-202ENST00000404455 623 ntTSL 56.6□□□□□ -1.353e-8■■■■■ 49.2
AATFQ9NY61 A2M-204ENST00000467091 533 ntTSL 53.87□□□□□ -1.793e-8■■■■■ 49.2
AATFQ9NY61 TCF3-208ENST00000586318 631 ntTSL 320.05■□□□□ 0.86e-8■■■■■ 48.9
AATFQ9NY61 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 48.7
AATFQ9NY61 NOC2L-203ENST00000477976 4201 ntTSL 513.24□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 48.7
AATFQ9NY61 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.33□□□□□ -1.561e-323■■■■■ 48.4
AATFQ9NY61 SNORD91B-201ENST00000391250 95 nt1.27□□□□□ -2.211e-323■■■■■ 48.4
AATFQ9NY61 GNL3-205ENST00000468146 533 ntTSL 412.49□□□□□ -0.415e-6■■■■■ 48.2
AATFQ9NY61 GNL3-210ENST00000492349 729 ntTSL 29.78□□□□□ -0.845e-6■■■■■ 48.2
AATFQ9NY61 GNL3-208ENST00000479230 547 ntTSL 43.69□□□□□ -1.825e-6■■■■■ 48.2
AATFQ9NY61 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.56□□□□□ -25e-6■■■■■ 48.2
AATFQ9NY61 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.795e-6■■■■■ 48.2
AATFQ9NY61 AGPAT4-204ENST00000436279 875 ntTSL 1 (best)12.41□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 48
AATFQ9NY61 AGPAT4-203ENST00000366911 7705 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 48
AATFQ9NY61 AGPAT4-201ENST00000320285 7865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 48
AATFQ9NY61 RN7SKP291-201ENST00000362961 327 ntBASIC11.56□□□□□ -0.563e-10■■■■■ 48
AATFQ9NY61 ZFAS1-210ENST00000623640 732 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.541e-51■■■■■ 48
AATFQ9NY61 NOP58-207ENST00000478941 508 ntTSL 37.33□□□□□ -1.241e-323■■■■■ 48
AATFQ9NY61 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.121e-323■■■■■ 48
AATFQ9NY61 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 413.88□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 47.9
AATFQ9NY61 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.13□□□□□ -2.232e-8■■■■■ 47.9
AATFQ9NY61 RBMX-210ENST00000565907 563 ntTSL 217.78■□□□□ 0.441e-323■■■■■ 47.3
AATFQ9NY61 RBMX-204ENST00000464781 1852 ntTSL 216.03■□□□□ 0.161e-323■■■■■ 47.3
AATFQ9NY61 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.131e-323■■■■■ 47.3
AATFQ9NY61 RBMX-208ENST00000563370 577 ntTSL 314.93□□□□□ -0.021e-323■■■■■ 47.3
AATFQ9NY61 RBMX-211ENST00000567262 477 ntTSL 514.93□□□□□ -0.021e-323■■■■■ 47.3
AATFQ9NY61 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.141e-323■■■■■ 47.3
AATFQ9NY61 RBMX-207ENST00000562646 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.571e-323■■■■■ 47.3
AATFQ9NY61 RBMX-202ENST00000419968 940 ntTSL 511.39□□□□□ -0.591e-323■■■■■ 47.3
AATFQ9NY61 RBMX-212ENST00000568578 4887 ntTSL 1 (best)10.88□□□□□ -0.671e-323■■■■■ 47.3
AATFQ9NY61 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.421e-323■■■■■ 47.3
AATFQ9NY61 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.34□□□□□ -2.361e-323■■■■■ 47.3
AATFQ9NY61 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.624e-6■■■■■ 47.1
AATFQ9NY61 GNB1L-204ENST00000453108 702 ntTSL 324.77■■□□□ 1.564e-6■■■■■ 47.1
AATFQ9NY61 GNB1L-206ENST00000481086 854 ntTSL 323.21■■□□□ 1.314e-6■■■■■ 47.1
AATFQ9NY61 GNB1L-205ENST00000460402 1197 ntTSL 322.19■■□□□ 1.144e-6■■■■■ 47.1
AATFQ9NY61 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.094e-6■■■■■ 47.1
AATFQ9NY61 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.014e-6■■■■■ 47.1
AATFQ9NY61 RALB-207ENST00000470417 1931 ntTSL 329.22■■■□□ 2.276e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 RALB-204ENST00000431732 767 ntTSL 527.62■■■□□ 2.016e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 26e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.976e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.966e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.86e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.726e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 STX18-209ENST00000512780 800 ntTSL 325.04■■□□□ 1.66e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.296e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 RALB-206ENST00000449649 667 ntTSL 520.42■□□□□ 0.866e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.826e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 ETNK1-203ENST00000538218 1659 ntTSL 1 (best)20.09■□□□□ 0.816e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 TUBGCP6-203ENST00000434349 830 ntTSL 520.03■□□□□ 0.86e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 RALB-202ENST00000412383 981 ntTSL 319.92■□□□□ 0.786e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.716e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 TUBGCP6-208ENST00000498611 5274 ntTSL 1 (best)19.32■□□□□ 0.686e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.556e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 RALB-205ENST00000447591 558 ntTSL 416.34■□□□□ 0.216e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.16e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.036e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.026e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.016e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.266e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 STX18-206ENST00000507908 771 ntTSL 312.3□□□□□ -0.446e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 ATG4A-206ENST00000457035 939 ntTSL 312.18□□□□□ -0.466e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 ATG4A-205ENST00000394892 935 ntTSL 310.87□□□□□ -0.676e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 ATG4A-202ENST00000345734 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.686e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 ATG4A-203ENST00000372232 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.866e-7■■■■■ 46.9
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