Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsmQ9JL96 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsmQ9JL96 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsmQ9JL96 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsmQ9JL96 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsmQ9JL96 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsmQ9JL96 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsmQ9JL96 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsmQ9JL96 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsmQ9JL96 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsmQ9JL96 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsmQ9JL96 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsmQ9JL96 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsmQ9JL96 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsmQ9JL96 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsmQ9JL96 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsmQ9JL96 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsmQ9JL96 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsmQ9JL96 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsmQ9JL96 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CtsmQ9JL96 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms