Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS9

Cwc15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc15Q9JHS9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cwc15Q9JHS9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cwc15Q9JHS9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cwc15Q9JHS9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cwc15Q9JHS9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cwc15Q9JHS9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cwc15Q9JHS9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cwc15Q9JHS9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cwc15Q9JHS9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cwc15Q9JHS9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cwc15Q9JHS9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cwc15Q9JHS9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cwc15Q9JHS9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cwc15Q9JHS9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cwc15Q9JHS9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cwc15Q9JHS9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc15Q9JHS9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cwc15Q9JHS9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms