Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb3Q9ERD7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb3Q9ERD7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb3Q9ERD7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb3Q9ERD7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb3Q9ERD7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb3Q9ERD7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb3Q9ERD7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb3Q9ERD7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb3Q9ERD7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb3Q9ERD7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb3Q9ERD7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb3Q9ERD7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb3Q9ERD7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb3Q9ERD7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb3Q9ERD7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb3Q9ERD7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb3Q9ERD7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb3Q9ERD7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb3Q9ERD7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb3Q9ERD7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb3Q9ERD7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb3Q9ERD7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb3Q9ERD7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb3Q9ERD7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb3Q9ERD7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb3Q9ERD7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb3Q9ERD7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb3Q9ERD7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb3Q9ERD7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb3Q9ERD7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb3Q9ERD7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb3Q9ERD7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb3Q9ERD7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb3Q9ERD7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb3Q9ERD7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb3Q9ERD7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb3Q9ERD7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb3Q9ERD7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb3Q9ERD7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb3Q9ERD7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubb3Q9ERD7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms