Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chp2Q9D869 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Chp2Q9D869 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chp2Q9D869 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chp2Q9D869 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chp2Q9D869 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chp2Q9D869 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chp2Q9D869 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chp2Q9D869 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chp2Q9D869 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chp2Q9D869 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chp2Q9D869 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chp2Q9D869 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chp2Q9D869 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chp2Q9D869 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chp2Q9D869 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chp2Q9D869 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms