Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2al3Q9D4U4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2al3Q9D4U4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2al3Q9D4U4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms