Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms