Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmem39aQ9CYC3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmem39aQ9CYC3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmem39aQ9CYC3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmem39aQ9CYC3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmem39aQ9CYC3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmem39aQ9CYC3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmem39aQ9CYC3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tmem39aQ9CYC3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmem39aQ9CYC3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmem39aQ9CYC3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmem39aQ9CYC3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmem39aQ9CYC3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmem39aQ9CYC3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmem39aQ9CYC3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmem39aQ9CYC3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmem39aQ9CYC3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmem39aQ9CYC3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmem39aQ9CYC3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmem39aQ9CYC3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmem39aQ9CYC3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmem39aQ9CYC3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmem39aQ9CYC3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmem39aQ9CYC3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmem39aQ9CYC3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmem39aQ9CYC3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmem39aQ9CYC3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmem39aQ9CYC3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmem39aQ9CYC3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmem39aQ9CYC3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmem39aQ9CYC3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmem39aQ9CYC3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmem39aQ9CYC3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmem39aQ9CYC3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmem39aQ9CYC3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmem39aQ9CYC3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmem39aQ9CYC3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmem39aQ9CYC3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmem39aQ9CYC3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem39aQ9CYC3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem39aQ9CYC3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem39aQ9CYC3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem39aQ9CYC3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem39aQ9CYC3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmem39aQ9CYC3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmem39aQ9CYC3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmem39aQ9CYC3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem39aQ9CYC3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem39aQ9CYC3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem39aQ9CYC3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem39aQ9CYC3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmem39aQ9CYC3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmem39aQ9CYC3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmem39aQ9CYC3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmem39aQ9CYC3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmem39aQ9CYC3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmem39aQ9CYC3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem39aQ9CYC3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmem39aQ9CYC3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmem39aQ9CYC3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmem39aQ9CYC3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmem39aQ9CYC3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmem39aQ9CYC3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmem39aQ9CYC3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmem39aQ9CYC3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmem39aQ9CYC3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmem39aQ9CYC3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmem39aQ9CYC3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem39aQ9CYC3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem39aQ9CYC3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem39aQ9CYC3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Tmem39aQ9CYC3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem39aQ9CYC3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tmem39aQ9CYC3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tmem39aQ9CYC3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmem39aQ9CYC3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmem39aQ9CYC3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms