Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Exo5Q9CXP9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Exo5Q9CXP9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Exo5Q9CXP9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exo5Q9CXP9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms