Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bbc3Q99ML1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bbc3Q99ML1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bbc3Q99ML1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Bbc3Q99ML1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bbc3Q99ML1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bbc3Q99ML1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Bbc3Q99ML1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbc3Q99ML1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbc3Q99ML1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbc3Q99ML1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbc3Q99ML1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbc3Q99ML1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbc3Q99ML1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbc3Q99ML1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbc3Q99ML1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbc3Q99ML1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbc3Q99ML1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbc3Q99ML1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bbc3Q99ML1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bbc3Q99ML1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bbc3Q99ML1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bbc3Q99ML1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bbc3Q99ML1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bbc3Q99ML1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bbc3Q99ML1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms