Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lims1Q99JW4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lims1Q99JW4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lims1Q99JW4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lims1Q99JW4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lims1Q99JW4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lims1Q99JW4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1203.1 ms