Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHF3Q92576 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF3Q92576 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms