Protein–RNA interactions for Protein: Q921U8

Smtn, Smoothelin, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmtnQ921U8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SmtnQ921U8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SmtnQ921U8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SmtnQ921U8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SmtnQ921U8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SmtnQ921U8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SmtnQ921U8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SmtnQ921U8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SmtnQ921U8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SmtnQ921U8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SmtnQ921U8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SmtnQ921U8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SmtnQ921U8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SmtnQ921U8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SmtnQ921U8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SmtnQ921U8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SmtnQ921U8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SmtnQ921U8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SmtnQ921U8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SmtnQ921U8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SmtnQ921U8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SmtnQ921U8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SmtnQ921U8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SmtnQ921U8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SmtnQ921U8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SmtnQ921U8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SmtnQ921U8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SmtnQ921U8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SmtnQ921U8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SmtnQ921U8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SmtnQ921U8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SmtnQ921U8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SmtnQ921U8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SmtnQ921U8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SmtnQ921U8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SmtnQ921U8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SmtnQ921U8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SmtnQ921U8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SmtnQ921U8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SmtnQ921U8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SmtnQ921U8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SmtnQ921U8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms