Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ6

Sgsm3, Small G protein signaling modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgsm3Q8VCZ6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgsm3Q8VCZ6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgsm3Q8VCZ6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgsm3Q8VCZ6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgsm3Q8VCZ6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgsm3Q8VCZ6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgsm3Q8VCZ6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm3Q8VCZ6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm3Q8VCZ6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm3Q8VCZ6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm3Q8VCZ6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm3Q8VCZ6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgsm3Q8VCZ6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgsm3Q8VCZ6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sgsm3Q8VCZ6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgsm3Q8VCZ6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sgsm3Q8VCZ6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sgsm3Q8VCZ6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sgsm3Q8VCZ6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgsm3Q8VCZ6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgsm3Q8VCZ6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgsm3Q8VCZ6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgsm3Q8VCZ6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgsm3Q8VCZ6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sgsm3Q8VCZ6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sgsm3Q8VCZ6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sgsm3Q8VCZ6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sgsm3Q8VCZ6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sgsm3Q8VCZ6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sgsm3Q8VCZ6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sgsm3Q8VCZ6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sgsm3Q8VCZ6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sgsm3Q8VCZ6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sgsm3Q8VCZ6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sgsm3Q8VCZ6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms