Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubxn4Q8VCH8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubxn4Q8VCH8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ubxn4Q8VCH8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubxn4Q8VCH8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubxn4Q8VCH8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubxn4Q8VCH8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ubxn4Q8VCH8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ubxn4Q8VCH8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ubxn4Q8VCH8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ubxn4Q8VCH8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubxn4Q8VCH8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubxn4Q8VCH8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubxn4Q8VCH8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubxn4Q8VCH8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubxn4Q8VCH8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubxn4Q8VCH8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubxn4Q8VCH8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ubxn4Q8VCH8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ubxn4Q8VCH8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubxn4Q8VCH8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ubxn4Q8VCH8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
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