Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup58Q8R332 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup58Q8R332 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup58Q8R332 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup58Q8R332 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup58Q8R332 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup58Q8R332 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup58Q8R332 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup58Q8R332 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup58Q8R332 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup58Q8R332 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup58Q8R332 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup58Q8R332 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup58Q8R332 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup58Q8R332 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nup58Q8R332 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup58Q8R332 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup58Q8R332 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nup58Q8R332 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nup58Q8R332 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup58Q8R332 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup58Q8R332 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup58Q8R332 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup58Q8R332 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup58Q8R332 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup58Q8R332 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup58Q8R332 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup58Q8R332 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup58Q8R332 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup58Q8R332 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup58Q8R332 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms