Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0C1

Ipo13, Importin-13, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipo13Q8K0C1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ipo13Q8K0C1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ipo13Q8K0C1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ipo13Q8K0C1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ipo13Q8K0C1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ipo13Q8K0C1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ipo13Q8K0C1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ipo13Q8K0C1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ipo13Q8K0C1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ipo13Q8K0C1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ipo13Q8K0C1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ipo13Q8K0C1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ipo13Q8K0C1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ipo13Q8K0C1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ipo13Q8K0C1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ipo13Q8K0C1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ipo13Q8K0C1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ipo13Q8K0C1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ipo13Q8K0C1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ipo13Q8K0C1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ipo13Q8K0C1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ipo13Q8K0C1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ipo13Q8K0C1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ipo13Q8K0C1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ipo13Q8K0C1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ipo13Q8K0C1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ipo13Q8K0C1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ipo13Q8K0C1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ipo13Q8K0C1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ipo13Q8K0C1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ipo13Q8K0C1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ipo13Q8K0C1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ipo13Q8K0C1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ipo13Q8K0C1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ipo13Q8K0C1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ipo13Q8K0C1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ipo13Q8K0C1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ipo13Q8K0C1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ipo13Q8K0C1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ipo13Q8K0C1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ipo13Q8K0C1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ipo13Q8K0C1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ipo13Q8K0C1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ipo13Q8K0C1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ipo13Q8K0C1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms