Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CntrobQ8CB62 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CntrobQ8CB62 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CntrobQ8CB62 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CntrobQ8CB62 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CntrobQ8CB62 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CntrobQ8CB62 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CntrobQ8CB62 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CntrobQ8CB62 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CntrobQ8CB62 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CntrobQ8CB62 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CntrobQ8CB62 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CntrobQ8CB62 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CntrobQ8CB62 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CntrobQ8CB62 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CntrobQ8CB62 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CntrobQ8CB62 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CntrobQ8CB62 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms