Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZT5

Lrrc19, Leucine-rich repeat-containing protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc19Q8BZT5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc19Q8BZT5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc19Q8BZT5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc19Q8BZT5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc19Q8BZT5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms