Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PcgF3Q8BTQ0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PcgF3Q8BTQ0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PcgF3Q8BTQ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms