Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ckap4Q8BMK4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ckap4Q8BMK4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ckap4Q8BMK4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms