Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prpf18Q8BM39 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf18Q8BM39 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf18Q8BM39 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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