Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Actn1Q7TPR4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Actn1Q7TPR4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Actn1Q7TPR4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Actn1Q7TPR4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Actn1Q7TPR4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Actn1Q7TPR4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Actn1Q7TPR4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Actn1Q7TPR4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Actn1Q7TPR4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Actn1Q7TPR4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Actn1Q7TPR4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Actn1Q7TPR4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Actn1Q7TPR4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Actn1Q7TPR4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Actn1Q7TPR4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Actn1Q7TPR4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Actn1Q7TPR4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Actn1Q7TPR4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Actn1Q7TPR4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Actn1Q7TPR4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Actn1Q7TPR4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Actn1Q7TPR4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Actn1Q7TPR4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Actn1Q7TPR4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Actn1Q7TPR4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Actn1Q7TPR4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Actn1Q7TPR4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Actn1Q7TPR4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Actn1Q7TPR4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Actn1Q7TPR4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Actn1Q7TPR4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Actn1Q7TPR4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Actn1Q7TPR4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Actn1Q7TPR4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Actn1Q7TPR4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Actn1Q7TPR4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Actn1Q7TPR4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Actn1Q7TPR4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Actn1Q7TPR4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Actn1Q7TPR4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Actn1Q7TPR4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Actn1Q7TPR4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Actn1Q7TPR4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Actn1Q7TPR4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Actn1Q7TPR4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Actn1Q7TPR4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Actn1Q7TPR4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Actn1Q7TPR4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Actn1Q7TPR4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms