Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M2Q6W9L1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M2Q6W9L1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M2Q6W9L1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M2Q6W9L1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M2Q6W9L1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M2Q6W9L1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M2Q6W9L1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M2Q6W9L1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M2Q6W9L1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M2Q6W9L1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M2Q6W9L1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M2Q6W9L1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M2Q6W9L1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M2Q6W9L1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M2Q6W9L1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2-M2Q6W9L1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms