Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q66JV7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q66JV7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q66JV7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q66JV7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q66JV7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q66JV7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q66JV7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q66JV7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q66JV7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q66JV7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q66JV7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q66JV7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q66JV7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q66JV7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q66JV7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q66JV7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Q66JV7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q66JV7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q66JV7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q66JV7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q66JV7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q66JV7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q66JV7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q66JV7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q66JV7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q66JV7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q66JV7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q66JV7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q66JV7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q66JV7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q66JV7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q66JV7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q66JV7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q66JV7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q66JV7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q66JV7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q66JV7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q66JV7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q66JV7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q66JV7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q66JV7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q66JV7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q66JV7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q66JV7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q66JV7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q66JV7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q66JV7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Q66JV7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q66JV7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q66JV7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q66JV7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q66JV7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q66JV7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q66JV7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q66JV7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q66JV7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q66JV7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q66JV7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q66JV7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q66JV7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q66JV7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q66JV7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q66JV7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q66JV7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q66JV7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q66JV7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q66JV7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q66JV7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q66JV7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q66JV7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q66JV7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q66JV7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q66JV7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q66JV7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q66JV7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q66JV7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q66JV7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q66JV7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q66JV7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q66JV7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q66JV7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q66JV7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q66JV7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q66JV7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q66JV7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q66JV7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q66JV7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q66JV7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q66JV7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q66JV7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q66JV7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q66JV7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q66JV7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q66JV7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q66JV7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q66JV7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Q66JV7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q66JV7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q66JV7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms