Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnfsf15Q5UBV8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf15Q5UBV8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms