Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930512M02RikQ5SQK8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930512M02RikQ5SQK8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930512M02RikQ5SQK8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930512M02RikQ5SQK8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930512M02RikQ5SQK8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930512M02RikQ5SQK8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930512M02RikQ5SQK8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930512M02RikQ5SQK8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930512M02RikQ5SQK8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930512M02RikQ5SQK8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930512M02RikQ5SQK8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930512M02RikQ5SQK8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930512M02RikQ5SQK8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4930512M02RikQ5SQK8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930512M02RikQ5SQK8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930512M02RikQ5SQK8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.3■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930512M02RikQ5SQK8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930512M02RikQ5SQK8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930512M02RikQ5SQK8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930512M02RikQ5SQK8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930512M02RikQ5SQK8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms