Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Taf3Q5HZG4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf3Q5HZG4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Taf3Q5HZG4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf3Q5HZG4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms