Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm44Q3V089 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm44Q3V089 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm44Q3V089 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm44Q3V089 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm44Q3V089 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm44Q3V089 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm44Q3V089 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm44Q3V089 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm44Q3V089 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm44Q3V089 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm44Q3V089 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm44Q3V089 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm44Q3V089 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm44Q3V089 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm44Q3V089 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm44Q3V089 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm44Q3V089 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm44Q3V089 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm44Q3V089 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm44Q3V089 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm44Q3V089 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rbm44Q3V089 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm44Q3V089 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm44Q3V089 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm44Q3V089 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm44Q3V089 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm44Q3V089 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm44Q3V089 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm44Q3V089 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm44Q3V089 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm44Q3V089 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm44Q3V089 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm44Q3V089 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm44Q3V089 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm44Q3V089 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm44Q3V089 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm44Q3V089 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm44Q3V089 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm44Q3V089 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm44Q3V089 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm44Q3V089 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm44Q3V089 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm44Q3V089 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm44Q3V089 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms