Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed1Q3V009 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tmed1Q3V009 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmed1Q3V009 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.5 ms