Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc114Q3UX62 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc114Q3UX62 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc114Q3UX62 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc114Q3UX62 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms