Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cln5Q3UMW8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cln5Q3UMW8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cln5Q3UMW8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cln5Q3UMW8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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