Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpr55Q3UJF0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpr55Q3UJF0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms